2011-08-01から1ヶ月間の記事一覧

Avadis NGS 動画 RNA-seq 編への下調べ (2)

先日のエントリで触れた論文を引き続き読んでいたが,なんでこの論文では発現量について触れられていないんだろう,と思ったら,この論文でのリードのフィルタリングの方式とも関係するようで. この論文ではこれはPCR増幅産物の影響などを取り除き,擬陽性が出る…

Avadis NGS 動画 RNA-seq 編への下調べ

Avadis NGS 動画,次は RNA-seq 編をつくろうと考えているのでその下調べ,構想練り中. Avadis NGS のサイトではソフトの試用のためのデモデータが提供されている(登録しないと見れないページ).そのデータは元々,論文"Detection of single nucleotide variatio…

英語の勉強と称して

単なる現実逃避に近いのだが,ジョイスの "Ulysses" だいぶ前に買ってみたのだが完全に書棚の肥やしというか漬物石というか,そのような状態であったこの小説の英語版を,パラパラとめくるなぞしている.. まだ最初の3ページ/全731ページ,まあもとより全て読破し…

Avadis NGS 動画一本目

できました. http://togotv.dbcls.jp/20110803.html思ったより時間がかかった…….まあよくある,ダウンロードする前にユーザー登録してねという方式ですが. この動画の後半,アノテーションデータのインポートに時間を割いたのは,これをやっておかないと,あとで…